17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2294 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  26.76 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  27.84 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  24.26 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  23.97 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  24.19 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  28.46 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  23.08 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  21.46 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  22.12 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  24.7 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  23.66 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  22.92 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3949  type IV pilus assembly PilZ  22.69 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  24.11 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0260  hypothetical protein  24.69 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  0.584816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>