14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0672 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  40.57 
 
 		 180 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  24.32 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  27.84 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  24.87 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  26.26 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  23.33 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  23.2 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  24.49 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  29.41 
 
 		 308 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  28.7 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  23.04 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>