14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05354 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  66.67 
 
 		 180 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  38.5 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  22.07 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  23.97 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  22.11 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  23.17 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  20.53 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1474  type IV pilus assembly PilZ  31 
 
 		 98 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  27.47 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  24.24 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  22.63 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>