18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01915 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  33.66 
 
 		 208 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  30.56 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  30.95 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3582  hypothetical protein  27.4 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  29.33 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  24.04 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  26.92 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0260  hypothetical protein  26.05 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  24.75 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3949  type IV pilus assembly PilZ  21.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2266  hypothetical protein  21.96 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  24.67 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  21 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  27.78 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  29.47 
 
 		 180 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  24.11 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>