17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2953 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  36.36 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  25.23 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  24.32 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  22.07 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  28 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  21.13 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  24.21 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  20.53 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  27.34 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  27.34 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  24.07 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  18.75 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  21.24 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  21 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  16.83 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3949  type IV pilus assembly PilZ  27.82 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>