19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3596 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  53.88 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  31.58 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  30.95 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  26.76 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  24.51 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  25.81 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  26.7 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  24.21 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  24.12 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  24.04 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3949  type IV pilus assembly PilZ  25.17 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3582  hypothetical protein  25.74 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2266  hypothetical protein  22.12 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  22.54 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  23.2 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  24.39 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  23.08 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0260  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  0.584816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>