22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1261 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  63.79 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  38.83 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  33.75 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  33.67 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  33.67 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  32.38 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  32.38 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  29.68 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  27.52 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  25.25 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  25.75 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  27.57 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  27 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  27 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  25.63 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  26.52 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  24.92 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  24.75 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  24.07 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>