15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5992 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 292 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  93.84 
 
 		 304 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  93.84 
 
 		 291 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  81.23 
 
 		 293 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  74.66 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  75 
 
 		 291 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  32.17 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  30.93 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  33.45 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  24.83 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  28.98 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  28.98 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  24.41 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  25.95 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.79 
 
 		 555 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>