39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0380 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  56.16 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  39.55 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  39.55 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  30.49 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  29.26 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  24.15 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  22.7 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  22.6 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  24.03 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  22.6 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  22.6 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  22.6 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  22.6 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  22.6 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  24.03 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  22.6 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  28.12 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  24.88 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  23.94 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  22.36 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  24.24 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  22.36 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  22.36 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  24.74 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  22.36 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  22.37 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  21.26 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  20.87 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  26.15 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  23.47 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  25.81 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  20.88 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0149  hypothetical protein  25.41 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2214  YcgR family protein  22.15 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  21.22 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  20.2 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0629  type IV pilus assembly PilZ  22.73 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.910498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3366  putative metal dependent phosphohydrolase  26.85 
 
 		 574 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>