More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0184 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0184  LSU ribosomal protein L12P  100 
 
 
126 aa  231  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278769  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
126 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  65.08 
 
 
126 aa  130  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
121 aa  120  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
123 aa  115  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
124 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  60.98 
 
 
128 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
125 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
127 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
122 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
122 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
122 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
119 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4325  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
122 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000520258  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
127 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
124 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
129 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 
129 aa  103  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
122 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
122 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
119 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
124 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
123 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  59.02 
 
 
123 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  57.38 
 
 
122 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
127 aa  100  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
125 aa  100  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
121 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
121 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
122 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  56.56 
 
 
124 aa  100  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
126 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1326  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2867  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  56.8 
 
 
129 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
127 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  44.72 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4698  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163845  hitchhiker  0.00000529046 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0188  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000136924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0192  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000934048  hitchhiker  0.00053412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  49.12 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  48.84 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  48.25 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4474  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
128 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
128 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2073  ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  48.41 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  46.67 
 
 
179 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  54.1 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  52.07 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
128 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01080  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
123 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
122 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  51.64 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  53.98 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  53.98 
 
 
123 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>