More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0268 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2617  maltooligosyl trehalose synthase  58.92 
 
 
776 aa  836    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2794  maltooligosyl trehalose synthase  57.33 
 
 
767 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0311674  decreased coverage  0.0000045816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2908  maltooligosyl trehalose synthase  55.63 
 
 
787 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.557464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0268  maltooligosyl trehalose synthase  100 
 
 
749 aa  1484    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.221794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1957  malto-oligosyltrehalose synthase  55.67 
 
 
774 aa  766    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03980  maltooligosyl trehalose synthase  50.25 
 
 
824 aa  665    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5113  malto-oligosyltrehalose synthase  49.48 
 
 
749 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2269  malto-oligosyltrehalose synthase  48.12 
 
 
794 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0794544  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2785  malto-oligosyltrehalose synthase  44.9 
 
 
763 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413376  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3081  malto-oligosyltrehalose synthase  44.85 
 
 
774 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3141  malto-oligosyltrehalose synthase  44.85 
 
 
774 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675938  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3098  malto-oligosyltrehalose synthase  44.85 
 
 
774 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0272659  normal  0.0829453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1349  malto-oligosyltrehalose synthase  42.42 
 
 
831 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11595  maltooligosyltrehalose synthase treY  45.9 
 
 
765 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3632  malto-oligosyltrehalose synthase  44.23 
 
 
762 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5165  malto-oligosyltrehalose synthase  42.79 
 
 
864 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1602  malto-oligosyltrehalose synthase  45.45 
 
 
727 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1742  malto-oligosyltrehalose synthase  44.17 
 
 
839 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0333079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16650  malto-oligosyltrehalose synthase  42.98 
 
 
846 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12221  normal  0.105789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3074  maltooligosyl trehalose synthase  43.63 
 
 
820 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1373  malto-oligosyltrehalose synthase  41.81 
 
 
780 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.424135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2979  malto-oligosyltrehalose synthase  43.15 
 
 
772 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13820  maltooligosyl trehalose synthase  41.04 
 
 
860 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1972  maltooligosyl trehalose synthase  39.73 
 
 
835 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.27486  hitchhiker  0.000139329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  38.35 
 
 
836 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  37.53 
 
 
856 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  37.24 
 
 
884 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  36.27 
 
 
843 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  36.52 
 
 
869 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  35.19 
 
 
842 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  35.19 
 
 
842 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  34.32 
 
 
934 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  34.95 
 
 
842 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  34.95 
 
 
842 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  35.15 
 
 
842 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2807  malto-oligosyltrehalose synthase  34.82 
 
 
732 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.212302  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  38.39 
 
 
948 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  36.41 
 
 
922 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  38.69 
 
 
986 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  37.79 
 
 
955 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.73 
 
 
1646 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  35.52 
 
 
913 aa  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.62 
 
 
1646 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  37.82 
 
 
969 aa  363  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  37.82 
 
 
969 aa  363  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.91 
 
 
1650 aa  361  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  32.56 
 
 
914 aa  360  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  38.57 
 
 
944 aa  353  5.9999999999999994e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  35.2 
 
 
1007 aa  353  7e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  34.32 
 
 
869 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  37.67 
 
 
928 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  39.55 
 
 
926 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  37.16 
 
 
848 aa  347  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.69 
 
 
1730 aa  346  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  32.83 
 
 
930 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  35.2 
 
 
955 aa  344  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.79 
 
 
1633 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.26 
 
 
1647 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  37.27 
 
 
928 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  32.91 
 
 
951 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  31.53 
 
 
942 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  37.54 
 
 
945 aa  337  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  31.82 
 
 
942 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  33.57 
 
 
994 aa  336  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  37.33 
 
 
929 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  34.27 
 
 
995 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  33.57 
 
 
994 aa  333  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  36.31 
 
 
879 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.31 
 
 
1642 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  32.88 
 
 
873 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  33.74 
 
 
996 aa  330  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  37.11 
 
 
1013 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  37.7 
 
 
871 aa  328  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  39.94 
 
 
939 aa  326  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  32.24 
 
 
952 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  33.63 
 
 
940 aa  325  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  36.52 
 
 
1007 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.12 
 
 
1715 aa  324  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  38.69 
 
 
869 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  36.38 
 
 
1007 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  31.57 
 
 
916 aa  320  7e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.78 
 
 
1662 aa  317  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  37.7 
 
 
871 aa  317  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  36.38 
 
 
1009 aa  317  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  34.01 
 
 
994 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  30.17 
 
 
927 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  33.18 
 
 
1405 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  32.36 
 
 
940 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  32.36 
 
 
940 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  32.04 
 
 
917 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  34.85 
 
 
1411 aa  310  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  34.43 
 
 
935 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  30.5 
 
 
927 aa  307  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  35.76 
 
 
944 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  33.77 
 
 
941 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  37.88 
 
 
950 aa  302  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  35.53 
 
 
918 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.62 
 
 
1673 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  36.52 
 
 
875 aa  298  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.36 
 
 
1703 aa  296  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>