More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3074 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1602  malto-oligosyltrehalose synthase  48.22 
 
 
727 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3074  maltooligosyl trehalose synthase  100 
 
 
820 aa  1627    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1349  malto-oligosyltrehalose synthase  49.05 
 
 
831 aa  695    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16650  malto-oligosyltrehalose synthase  57.59 
 
 
846 aa  876    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12221  normal  0.105789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5165  malto-oligosyltrehalose synthase  49.7 
 
 
864 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13820  maltooligosyl trehalose synthase  52.46 
 
 
860 aa  773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1972  maltooligosyl trehalose synthase  55.66 
 
 
835 aa  786    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.27486  hitchhiker  0.000139329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1742  malto-oligosyltrehalose synthase  59.05 
 
 
839 aa  882    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0333079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1957  malto-oligosyltrehalose synthase  48.47 
 
 
774 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5113  malto-oligosyltrehalose synthase  45.84 
 
 
749 aa  568  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1373  malto-oligosyltrehalose synthase  43.85 
 
 
780 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.424135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2617  maltooligosyl trehalose synthase  44.51 
 
 
776 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2908  maltooligosyl trehalose synthase  43.25 
 
 
787 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.557464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2794  maltooligosyl trehalose synthase  44.99 
 
 
767 aa  545  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0311674  decreased coverage  0.0000045816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2269  malto-oligosyltrehalose synthase  45.27 
 
 
794 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0794544  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0268  maltooligosyl trehalose synthase  43.52 
 
 
749 aa  525  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.221794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2785  malto-oligosyltrehalose synthase  43.13 
 
 
763 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413376  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03980  maltooligosyl trehalose synthase  43.11 
 
 
824 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  39.77 
 
 
856 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3632  malto-oligosyltrehalose synthase  43.24 
 
 
762 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3081  malto-oligosyltrehalose synthase  42.08 
 
 
774 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3141  malto-oligosyltrehalose synthase  42.08 
 
 
774 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675938  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3098  malto-oligosyltrehalose synthase  42.08 
 
 
774 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0272659  normal  0.0829453 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  37.91 
 
 
843 aa  465  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11595  maltooligosyltrehalose synthase treY  39.95 
 
 
765 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  38.3 
 
 
884 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  37.9 
 
 
869 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  36.96 
 
 
836 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  36.48 
 
 
869 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  35.91 
 
 
842 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  35.82 
 
 
842 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  36.15 
 
 
869 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  35.79 
 
 
842 aa  439  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  35.55 
 
 
842 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  35.47 
 
 
842 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  36.08 
 
 
918 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  36.21 
 
 
873 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  35.96 
 
 
969 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  35.96 
 
 
969 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2573  malto-oligosyltrehalose synthase  32.78 
 
 
875 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  39.21 
 
 
986 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.81 
 
 
1730 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  39.27 
 
 
1013 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  36.06 
 
 
922 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  39.2 
 
 
1009 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  39.33 
 
 
1007 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2979  malto-oligosyltrehalose synthase  37.67 
 
 
772 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  39.33 
 
 
1007 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  37.13 
 
 
930 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2807  malto-oligosyltrehalose synthase  34.39 
 
 
732 aa  395  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.212302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  35.33 
 
 
951 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  36.85 
 
 
944 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  34.53 
 
 
914 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  35 
 
 
942 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  41.64 
 
 
913 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  34.86 
 
 
942 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  36.41 
 
 
996 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.91 
 
 
1673 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  34.62 
 
 
875 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  38.32 
 
 
955 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  33.78 
 
 
848 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  35.25 
 
 
995 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.54 
 
 
1715 aa  376  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  38.46 
 
 
948 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  32.83 
 
 
940 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  33.47 
 
 
952 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  37.33 
 
 
934 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.24 
 
 
1642 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  36.26 
 
 
994 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  34.86 
 
 
1007 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0039  malto-oligosyltrehalose synthase  34.35 
 
 
909 aa  366  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.27 
 
 
1662 aa  364  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.21 
 
 
1650 aa  364  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  35.86 
 
 
994 aa  364  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.43 
 
 
1647 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  37.07 
 
 
955 aa  363  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  38.36 
 
 
945 aa  361  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  37.38 
 
 
944 aa  360  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  34.34 
 
 
994 aa  360  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  35.92 
 
 
1405 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  37.1 
 
 
879 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  40.88 
 
 
921 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  40.88 
 
 
921 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  38 
 
 
926 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.66 
 
 
1633 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.01 
 
 
1646 aa  354  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.16 
 
 
1646 aa  353  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  40.29 
 
 
939 aa  352  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  37.74 
 
 
929 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  40.88 
 
 
922 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  40.59 
 
 
924 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  35.8 
 
 
928 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  37.56 
 
 
928 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  32.31 
 
 
927 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  39.62 
 
 
924 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  32.6 
 
 
927 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  39.35 
 
 
923 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.7 
 
 
1703 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  36.23 
 
 
940 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  36.23 
 
 
940 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.734301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>