More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5113 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2269  malto-oligosyltrehalose synthase  56.16 
 
 
794 aa  784    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0794544  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2794  maltooligosyl trehalose synthase  51.31 
 
 
767 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0311674  decreased coverage  0.0000045816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5113  malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 
749 aa  1473    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1957  malto-oligosyltrehalose synthase  52.02 
 
 
774 aa  663    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2617  maltooligosyl trehalose synthase  48.19 
 
 
776 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0268  maltooligosyl trehalose synthase  49.48 
 
 
749 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.221794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2908  maltooligosyl trehalose synthase  46.45 
 
 
787 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.557464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1602  malto-oligosyltrehalose synthase  48.08 
 
 
727 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3632  malto-oligosyltrehalose synthase  44.1 
 
 
762 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13820  maltooligosyl trehalose synthase  44.14 
 
 
860 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2785  malto-oligosyltrehalose synthase  44.65 
 
 
763 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413376  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1349  malto-oligosyltrehalose synthase  43.39 
 
 
831 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5165  malto-oligosyltrehalose synthase  43.85 
 
 
864 aa  545  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3074  maltooligosyl trehalose synthase  45.6 
 
 
820 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3081  malto-oligosyltrehalose synthase  44.22 
 
 
774 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3098  malto-oligosyltrehalose synthase  44.22 
 
 
774 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0272659  normal  0.0829453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3141  malto-oligosyltrehalose synthase  44.22 
 
 
774 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675938  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11595  maltooligosyltrehalose synthase treY  43.97 
 
 
765 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1373  malto-oligosyltrehalose synthase  43.46 
 
 
780 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.424135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16650  malto-oligosyltrehalose synthase  42.7 
 
 
846 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12221  normal  0.105789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1742  malto-oligosyltrehalose synthase  43.24 
 
 
839 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0333079 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03980  maltooligosyl trehalose synthase  50.33 
 
 
824 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1972  maltooligosyl trehalose synthase  41.23 
 
 
835 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.27486  hitchhiker  0.000139329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  37.28 
 
 
884 aa  439  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  37.82 
 
 
856 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2979  malto-oligosyltrehalose synthase  38.33 
 
 
772 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  37.02 
 
 
869 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  34.01 
 
 
842 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  34.13 
 
 
842 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  34.21 
 
 
842 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  34.05 
 
 
842 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  38.02 
 
 
955 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  33.81 
 
 
842 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  42.57 
 
 
913 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  34.95 
 
 
930 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  36.06 
 
 
922 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  39.06 
 
 
986 aa  379  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.93 
 
 
1730 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  35.27 
 
 
836 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  35.39 
 
 
1007 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  39.11 
 
 
944 aa  364  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2807  malto-oligosyltrehalose synthase  33.29 
 
 
732 aa  362  1e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.212302  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  34.48 
 
 
843 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  35.64 
 
 
955 aa  362  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  34.08 
 
 
942 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.01 
 
 
1715 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  38.62 
 
 
879 aa  358  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  38.07 
 
 
1009 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  34.08 
 
 
942 aa  356  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  37.63 
 
 
948 aa  353  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  39.88 
 
 
969 aa  352  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  39.88 
 
 
969 aa  352  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.11 
 
 
1662 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  35.35 
 
 
995 aa  350  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  37.75 
 
 
869 aa  350  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  37.58 
 
 
848 aa  349  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.73 
 
 
1646 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  37.61 
 
 
1013 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.58 
 
 
1646 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  38.03 
 
 
1007 aa  346  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  37.23 
 
 
869 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  37.86 
 
 
1007 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.63 
 
 
1650 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  33.91 
 
 
940 aa  340  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  35.75 
 
 
996 aa  339  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  35.4 
 
 
1405 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  37.52 
 
 
945 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  35.95 
 
 
944 aa  334  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  35.22 
 
 
927 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  35.58 
 
 
927 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.5 
 
 
1642 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.36 
 
 
1633 aa  331  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  34.88 
 
 
1411 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  36.77 
 
 
952 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  39.58 
 
 
939 aa  328  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  36.22 
 
 
951 aa  328  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.13 
 
 
1647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  37.43 
 
 
914 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  34.7 
 
 
994 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  37.31 
 
 
926 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  36.63 
 
 
934 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  36.05 
 
 
929 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  33.68 
 
 
935 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  33.24 
 
 
994 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  38.45 
 
 
921 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  38.45 
 
 
921 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  36.08 
 
 
918 aa  314  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  32.94 
 
 
941 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  34.71 
 
 
940 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  34.71 
 
 
940 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  33.62 
 
 
994 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  38.3 
 
 
922 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  36.76 
 
 
875 aa  312  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  33.87 
 
 
924 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  37.01 
 
 
871 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  35.44 
 
 
924 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  32.04 
 
 
916 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  36.89 
 
 
926 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  36.87 
 
 
940 aa  308  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  34.56 
 
 
924 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>