99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3057 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3057  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
224 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5227  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  71.82 
 
 
225 aa  291  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3708  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  64.55 
 
 
221 aa  249  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1633  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.82 
 
 
221 aa  209  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.965631  normal  0.349728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.73 
 
 
224 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  28.51 
 
 
251 aa  58.9  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.13 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.76 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.98 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.35 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.81 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.81 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.81 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.07 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.44 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.28 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.32 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.7 
 
 
257 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.94 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.3 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.94 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.28 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.94 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.94 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  23.94 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.94 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.94 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.17 
 
 
306 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.43 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  29.6 
 
 
230 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.81 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.3 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.37 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.05 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  25.93 
 
 
403 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  29.33 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.92 
 
 
248 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.34 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.95 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.93 
 
 
403 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.81 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3253  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.84 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0400175  normal  0.222904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.27 
 
 
695 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.52 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.32 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.52 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0051  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.28 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.52 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.44 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  28.24 
 
 
242 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.55 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1426  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.52 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.29 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24250  cytochrome c biogenesis protein  30.67 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0600094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.05 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.46 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.06 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.33 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.14 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  29.17 
 
 
658 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.26 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.14 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 
236 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.42 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.91 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.26 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2672  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.91 
 
 
270 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.8 
 
 
242 aa  45.1  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0826  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.03 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.8 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.28 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.23 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.95 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.77 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.38 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.46 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0867  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.65 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265338  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.54 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.91 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02950  cytochrome c biogenesis protein  31.94 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.95 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.81 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.33 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.84 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  29.6 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1899  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.54 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000193089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  25.45 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1037  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.79 
 
 
276 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1735  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.79 
 
 
401 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.21 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.05 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.79 
 
 
398 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.53 
 
 
672 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.49 
 
 
222 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1205 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.67 
 
 
243 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.59 
 
 
301 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>