82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2962 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 224 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3057  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.73 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5227  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.79 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1633  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.6 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.965631  normal  0.349728 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3708  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.24 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.19 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.93 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.27 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.71 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.49 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.66 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.29 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.8 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.69 
 
 		 297 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.27 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.27 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.27 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.27 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.27 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  24.27 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.27 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.63 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.1 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.23 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.98 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.3 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.95 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.27 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.86 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.4 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.47 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.47 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.95 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.42 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.77 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.18 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.64 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.43 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.06 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.06 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.06 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  27.85 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.76 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.18 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1735  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.75 
 
 		 401 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.44 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.84 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.96 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.55 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.07 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  32.08 
 
 		 402 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5009  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.76 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.082972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.29 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2163  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.55 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0104507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.07 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4203  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.5 
 
 		 305 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.34 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.94 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  26.88 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.32 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.63 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.12 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.95 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.23 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.35 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.35 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.94 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.91 
 
 		 242 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.93 
 
 		 244 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2222  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.35 
 
 		 243 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.59 
 
 		 247 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.7 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.56 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.49 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.37 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.14 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.85 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>