60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2075 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 297 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.42 
 
 		 257 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.09 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  50.53 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.83 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  42.37 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.89 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.11 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.33 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.4 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.42 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.46 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.46 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.56 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2317  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000398052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.01 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.11 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.56 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.11 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.11 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.76 
 
 		 223 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.47 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.03 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.17 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.61 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  31.4 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.72 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.88 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.39 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.11 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.13 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.88 
 
 		 266 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_557  cytochrome c biogenesis-type protein  28.26 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.22 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  25.34 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.7 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.22 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.7 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.22 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  23.22 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.22 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.58 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.55 
 
 		 398 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1735  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.55 
 
 		 401 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.41 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.52 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  21.03 
 
 		 403 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.29 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.29 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.14 
 
 		 222 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>