89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2154 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
257 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.73 
 
 
303 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61.54 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.79 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  47.53 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  45.88 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.7 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.72 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.53 
 
 
341 aa  101  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.14 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.84 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.41 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.11 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.74 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.04 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.22 
 
 
396 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.03 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.86 
 
 
224 aa  56.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.2 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.46 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  27.04 
 
 
242 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.18 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  29.07 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.12 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.44 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0619  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  33.04 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.44 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.94 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.76 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.11 
 
 
218 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.75 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_557  cytochrome c biogenesis-type protein  31.58 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  29.15 
 
 
631 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.58 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.37 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.6 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.95 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.43 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.13 
 
 
264 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  28.88 
 
 
617 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 
242 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.09 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.32 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  27.81 
 
 
611 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.02 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.02 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3057  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.67 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  27.81 
 
 
615 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.33 
 
 
222 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.22 
 
 
251 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.51 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.97 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.14 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.65 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  28.49 
 
 
626 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 
611 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  28.96 
 
 
618 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 
240 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.128991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  23.01 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.96 
 
 
583 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.71 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.63 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  27.81 
 
 
615 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  27.81 
 
 
615 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  27.81 
 
 
627 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5227  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.18 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.44 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.64 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.64 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.42 
 
 
583 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 
614 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.17 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.44 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6714  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.18 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  28.24 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  22.57 
 
 
403 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.89 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  27.04 
 
 
735 aa  42.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.45 
 
 
227 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.42 
 
 
207 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.84 
 
 
595 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.84 
 
 
595 aa  42  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.84 
 
 
595 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>