47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4527 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 321 aa  613  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.43 
 
 		 341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.53 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.96 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.28 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.91 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.3 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.11 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  38.12 
 
 		 287 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.61 
 
 		 229 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.96 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.14 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  26.34 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.36 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.79 
 
 		 235 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  26.89 
 
 		 735 aa  49.3  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.93 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.95 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.33 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  26.41 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.84 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.1 
 
 		 223 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.86 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.86 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.27 
 
 		 223 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.37 
 
 		 672 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  28.15 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  29.02 
 
 		 618 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.74 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.02 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.57 
 
 		 948 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.29 
 
 		 695 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.24 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03720  cytochrome c biogenesis protein  27.92 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.113523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.3 
 
 		 673 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  22.83 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.36 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.53 
 
 		 249 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.53 
 
 		 249 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.53 
 
 		 249 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  29.1 
 
 		 626 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.67 
 
 		 222 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  41.67 
 
 		 222 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2870  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.11 
 
 		 222 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.26 
 
 		 247 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>