74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1774 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 253 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.7 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.17 
 
 		 341 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.82 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.22 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.68 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.13 
 
 		 303 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.07 
 
 		 297 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.81 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.96 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  39.37 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.76 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.44 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.42 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.11 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  27.85 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_557  cytochrome c biogenesis-type protein  28.02 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.57 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  27.15 
 
 		 396 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.32 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  27.7 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.57 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.83 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.96 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.86 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.5 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.01 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.99 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2317  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.11 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000398052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.34 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.89 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.89 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.89 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.34 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.34 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.34 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.34 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.14 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.14 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.34 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.89 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.98 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.98 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.98 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.98 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.21 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.16 
 
 		 583 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.88 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 583 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.66 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.4 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.76 
 
 		 672 aa  45.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.72 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.86 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.56 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.38 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.19 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.29 
 
 		 666 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2087  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.22 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  31.43 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.17 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.23 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.51 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  27.78 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.82 
 
 		 595 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.41 
 
 		 673 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.61 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.128991  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.82 
 
 		 595 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.82 
 
 		 595 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.39 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.76 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 		 227 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>