More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1186 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
227 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  78.41 
 
 
228 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  73.89 
 
 
228 aa  328  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  68.72 
 
 
228 aa  321  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  75.33 
 
 
228 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  68.72 
 
 
228 aa  298  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  67.84 
 
 
228 aa  274  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.08 
 
 
223 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  34.36 
 
 
230 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.01 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  34.36 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.81 
 
 
246 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.81 
 
 
246 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.72 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.29 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.87 
 
 
249 aa  114  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.23 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.86 
 
 
253 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.95 
 
 
244 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  38.92 
 
 
252 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.2 
 
 
466 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.98 
 
 
234 aa  99  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.7 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  31.4 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.88 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  35.24 
 
 
611 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
231 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  36.46 
 
 
471 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.57 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.57 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.92 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.67 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.44 
 
 
218 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.09 
 
 
218 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.64 
 
 
471 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.94 
 
 
210 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.64 
 
 
471 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  29.67 
 
 
586 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
237 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  29.67 
 
 
586 aa  85.1  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  32.39 
 
 
623 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.18 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.2 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  28.84 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.82 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.44 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.28 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
242 aa  79  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.34 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54791  biogenesis protein  29.17 
 
 
382 aa  78.6  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  26.51 
 
 
449 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.53 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  32.27 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  30.54 
 
 
608 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.12 
 
 
586 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  33.01 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.05 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.44 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.56 
 
 
810 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  31.34 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  33.16 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.64 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  29.61 
 
 
630 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.23 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.15 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.23 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  26.94 
 
 
403 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  32.47 
 
 
605 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  30.88 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.19 
 
 
624 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.91 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.64 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  26.94 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.66 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.65 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  32.18 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.77 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.44 
 
 
626 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.19 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.54 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.45 
 
 
624 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.55 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.02 
 
 
608 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.93 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.7 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  28.82 
 
 
632 aa  72.8  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.66 
 
 
570 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.85 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.36 
 
 
583 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.99 
 
 
600 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  30.84 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.84 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.95 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  30.84 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.84 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.46 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.63 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.63 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>