More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1218 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
233 aa  450  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  42.29 
 
 
230 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  42.29 
 
 
230 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  40.19 
 
 
228 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.19 
 
 
228 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.61 
 
 
227 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.57 
 
 
228 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.85 
 
 
228 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.91 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.5 
 
 
228 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.48 
 
 
223 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.77 
 
 
234 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.96 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  30.21 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.8 
 
 
243 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.09 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.13 
 
 
613 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.16 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.16 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.13 
 
 
613 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.13 
 
 
613 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.69 
 
 
610 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.26 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
628 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.41 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  32.17 
 
 
586 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.21 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  31.74 
 
 
586 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  31.5 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.71 
 
 
624 aa  84.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  31.5 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.62 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.69 
 
 
609 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
611 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
610 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.73 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.95 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.35 
 
 
789 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
595 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.66 
 
 
570 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
595 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
595 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.81 
 
 
607 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.9 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.52 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.23 
 
 
631 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.31 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  30.66 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  32.46 
 
 
603 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.98 
 
 
592 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 
608 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.57 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.98 
 
 
600 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.71 
 
 
570 aa  75.1  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.28 
 
 
561 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.79 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.88 
 
 
572 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.79 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  31.82 
 
 
623 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  30.81 
 
 
575 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.77 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.94 
 
 
563 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.74 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.48 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
565 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  33.73 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54791  biogenesis protein  28.28 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.34 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  33.73 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  33.9 
 
 
750 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.34 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.34 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.92 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  35.42 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.34 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.74 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.18 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.53 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.34 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.12 
 
 
583 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.15 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.41 
 
 
466 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.94 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0174  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.22 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.26 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.98 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  29.89 
 
 
449 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  34.03 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  32.24 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>