261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54791 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_54791  biogenesis protein  100 
 
 
382 aa  754    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.02 
 
 
246 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.68 
 
 
246 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.53 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 
243 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.14 
 
 
249 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.98 
 
 
253 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  30.94 
 
 
225 aa  93.2  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.89 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.32 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  25 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.8 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.17 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.43 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.35 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.69 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.65 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.31 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.6 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  27.23 
 
 
586 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  27.23 
 
 
586 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  29.02 
 
 
216 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  24.84 
 
 
570 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.6 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.52 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.87 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1670  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1604  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  25.83 
 
 
575 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1494  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.69 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0619  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  30.09 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  32.13 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.89 
 
 
613 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.89 
 
 
613 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.89 
 
 
613 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.51 
 
 
228 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  25 
 
 
230 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.11 
 
 
628 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.55 
 
 
604 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.45 
 
 
619 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.45 
 
 
619 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.45 
 
 
619 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  26.01 
 
 
630 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.45 
 
 
619 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.11 
 
 
610 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  25.69 
 
 
449 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.72 
 
 
228 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.21 
 
 
218 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  26.44 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.77 
 
 
609 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.47 
 
 
236 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.12 
 
 
624 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.7 
 
 
602 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.23 
 
 
608 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.29 
 
 
225 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  25.1 
 
 
251 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  25 
 
 
607 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  24.82 
 
 
228 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.55 
 
 
611 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  24.51 
 
 
605 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_557  cytochrome c biogenesis-type protein  26.69 
 
 
240 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.42 
 
 
626 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.42 
 
 
610 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.56 
 
 
592 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.72 
 
 
810 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.34 
 
 
210 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.71 
 
 
235 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.21 
 
 
624 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.21 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  24.44 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  25.7 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.47 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  25.87 
 
 
632 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  26.61 
 
 
244 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.07 
 
 
583 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  24.65 
 
 
623 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.98 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.85 
 
 
235 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.58 
 
 
752 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  30.73 
 
 
557 aa  56.6  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1899  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.56 
 
 
215 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000193089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.28 
 
 
237 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.07 
 
 
583 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  20.96 
 
 
215 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  22.94 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  22.94 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  22.94 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  22.83 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  22.94 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  47.83 
 
 
558 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  23.55 
 
 
617 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  22.94 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.92 
 
 
227 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  22.83 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  26.85 
 
 
623 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.61 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.28 
 
 
233 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  24.6 
 
 
615 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.51 
 
 
227 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  24.6 
 
 
615 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>