More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2278 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.85 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.85 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.31 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  34.95 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.46 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.06 
 
 
218 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.95 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.49 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.95 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  31.63 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  36.87 
 
 
237 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.8 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.46 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.02 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2354  cytochrome c biogenesis protein  29.11 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000264437  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  34.23 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.8 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.19 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.19 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.19 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  27.1 
 
 
735 aa  73.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  33.66 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.94 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.61 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.07 
 
 
243 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.28 
 
 
628 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.35 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.31 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.91 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.84 
 
 
611 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.68 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.85 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.65 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.26 
 
 
613 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.26 
 
 
613 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  32.2 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.85 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  25.63 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.26 
 
 
613 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.53 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.07 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.64 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.95 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.11 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  32.45 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.74 
 
 
610 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.26 
 
 
619 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  26.29 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  29.86 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.2 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.57 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.74 
 
 
619 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.89 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.74 
 
 
619 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.74 
 
 
619 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.57 
 
 
563 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.58 
 
 
570 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.44 
 
 
607 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.4 
 
 
561 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.85 
 
 
610 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.91 
 
 
602 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.38 
 
 
609 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.96 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.23 
 
 
604 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.42 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.72 
 
 
572 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.67 
 
 
608 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.35 
 
 
631 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.95 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.49 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.38 
 
 
583 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  30.11 
 
 
449 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.54 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.94 
 
 
565 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.04 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.18 
 
 
250 aa  62  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.36 
 
 
583 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.87 
 
 
567 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.87 
 
 
567 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.87 
 
 
567 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.88 
 
 
565 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.8 
 
 
592 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.87 
 
 
567 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.41 
 
 
595 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.41 
 
 
595 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  29.09 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.87 
 
 
567 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.92 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.41 
 
 
595 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.35 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.05 
 
 
624 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>