280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1825 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 278 aa  517  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 		 228 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.94 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.68 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  25.52 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.52 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.29 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.92 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.21 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.07 
 
 		 613 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.07 
 
 		 613 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.07 
 
 		 613 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.07 
 
 		 610 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 619 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 619 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 619 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 619 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.64 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.88 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.11 
 
 		 628 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.22 
 
 		 624 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.1 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  26.04 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.26 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.77 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.2 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.94 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  31.14 
 
 		 618 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  33.71 
 
 		 630 aa  65.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.79 
 
 		 810 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.88 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.94 
 
 		 609 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  33.49 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.38 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.23 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  33.14 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  30.66 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  30.19 
 
 		 586 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.42 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.3 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.34 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.63 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  29.05 
 
 		 449 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.49 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.78 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.07 
 
 		 602 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  32.81 
 
 		 623 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.8 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  26.72 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.67 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  27.42 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.31 
 
 		 600 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.2 
 
 		 752 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.92 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.92 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.92 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  27.93 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.22 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  34.36 
 
 		 611 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  29.82 
 
 		 611 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  27.27 
 
 		 750 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  32.42 
 
 		 631 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  29.82 
 
 		 611 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  30.26 
 
 		 626 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.22 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  26.89 
 
 		 575 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.7 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.44 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  31.22 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.57 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.52 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.51 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  29.82 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  28.51 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  29.82 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.36 
 
 		 590 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  29.82 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.46 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  30.57 
 
 		 627 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.17 
 
 		 624 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.36 
 
 		 590 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  32.56 
 
 		 608 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  25.32 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  29.82 
 
 		 617 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.45 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.81 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.24 
 
 		 635 aa  55.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.21 
 
 		 607 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  29.91 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  29.91 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  31.25 
 
 		 642 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.8 
 
 		 592 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.22 
 
 		 612 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  30.13 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  32.93 
 
 		 577 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.21 
 
 		 592 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.56 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.86 
 
 		 590 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.43 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.56 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>