90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2887 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 236 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  71.12 
 
 		 234 aa  332  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  73.3 
 
 		 225 aa  330  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  69.49 
 
 		 235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.57 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.26 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1088  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.2 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1026  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.71 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.06 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  28.02 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.88 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.39 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.49 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  29.31 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.73 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.43 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.17 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.96 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.15 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489935 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.11 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.11 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  23.46 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.84 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.84 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.84 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.77 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.4 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.93 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.25 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.76 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.9 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.06 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.15 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.69 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.06 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  27.83 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.12 
 
 		 752 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.74 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.35 
 
 		 583 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.07 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.3 
 
 		 583 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  23.85 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  23.15 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.57 
 
 		 595 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.57 
 
 		 595 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0174  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.97 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.57 
 
 		 595 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.39 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.52 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.37 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.05 
 
 		 948 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 		 642 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.96 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.92 
 
 		 612 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  24.26 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  23.53 
 
 		 396 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  28.39 
 
 		 611 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  26.11 
 
 		 623 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.28 
 
 		 570 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  27.36 
 
 		 577 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  27.95 
 
 		 471 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2028  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.26 
 
 		 767 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000881449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.46 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.21 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.57 
 
 		 672 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.3 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.71 
 
 		 721 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  27.04 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  27.27 
 
 		 623 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.94 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  24.14 
 
 		 731 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.18 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.5 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1725  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.87 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  23.68 
 
 		 325 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  22.66 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.53 
 
 		 242 aa  42  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04721  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 		 222 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0681  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.97 
 
 		 229 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  22 
 
 		 570 aa  42  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.7 
 
 		 616 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.7 
 
 		 616 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.87 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.87 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0868  putative cytochrome c biogenesis protein  23.87 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.87484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.27 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>