110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2782 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  74.36 
 
 
234 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  71.17 
 
 
225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  69.49 
 
 
236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.26 
 
 
231 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.49 
 
 
234 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1088  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.75 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1026  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.25 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  29.22 
 
 
230 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  29.68 
 
 
230 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.31 
 
 
228 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.17 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.31 
 
 
228 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.5 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.42 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.77 
 
 
243 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.21 
 
 
233 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.83 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.46 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.46 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.51 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.17 
 
 
232 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.489935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.8 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.17 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.53 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.53 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.7 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.28 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.18 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.17 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.67 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.53 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.62 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  26.29 
 
 
396 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  24.14 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.92 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  25.6 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  26.51 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.68 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.85 
 
 
222 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.16 
 
 
223 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.71 
 
 
246 aa  52  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.11 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.28 
 
 
570 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.53 
 
 
608 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.47 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.14 
 
 
595 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.14 
 
 
595 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.14 
 
 
595 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.93 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.33 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  28.1 
 
 
642 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.42 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  26.04 
 
 
611 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.09 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.07 
 
 
242 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.82 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  26.05 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.78 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.95 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  21.24 
 
 
602 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.28 
 
 
628 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.46 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 
789 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  29.01 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  23.26 
 
 
242 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.02 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.78 
 
 
752 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.12 
 
 
561 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.9 
 
 
624 aa  45.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.62 
 
 
721 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04721  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.99 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.28 
 
 
300 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.1 
 
 
583 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.41 
 
 
626 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  21.76 
 
 
624 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.49 
 
 
583 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  22.63 
 
 
574 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.9 
 
 
631 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.86 
 
 
563 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  25.66 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  20.73 
 
 
609 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  25.28 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.11 
 
 
948 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  21.56 
 
 
607 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.29 
 
 
567 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.29 
 
 
567 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.29 
 
 
567 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.29 
 
 
567 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.29 
 
 
567 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.55 
 
 
572 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  21.24 
 
 
610 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4600  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.71 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.81 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3524  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.71 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239201  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.53 
 
 
592 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>