107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3646 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
232 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.489935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1088  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  65.37 
 
 
232 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1026  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  65.37 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  65.67 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.26 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.91 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  34.3 
 
 
235 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.2 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.1 
 
 
225 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  28.7 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  29.57 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.05 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.26 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.98 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.31 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.31 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.96 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.46 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  35.2 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.46 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  31.55 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  31.64 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.6 
 
 
246 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.6 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.28 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.69 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.17 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.67 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.47 
 
 
218 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.5 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  31.53 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.51 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.67 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  24.62 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.53 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.64 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.51 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.72 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.48 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  28.26 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.73 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4260  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.56 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.4 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.96 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.48 
 
 
264 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.52 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.73 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.73 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2733  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.68 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0356838  normal  0.0597692 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  29.44 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  30.9 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.96 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  32.24 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  29.44 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.99 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.96 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.62 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4148  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.24 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.2 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.1 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.37 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  28.87 
 
 
731 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.5 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  30.41 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.68 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1423  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0949063  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2222  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.96 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.91 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.12 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.15 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  28.31 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  34.27 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.49 
 
 
611 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  33.14 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  25.57 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.03 
 
 
610 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.68 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.03 
 
 
613 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.11 
 
 
613 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.03 
 
 
613 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.72 
 
 
607 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.32 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.95 
 
 
583 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.37 
 
 
445 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.65 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.6 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.55 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.49 
 
 
604 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.11 
 
 
609 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.95 
 
 
583 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  29.94 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.01 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2028  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.46 
 
 
767 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000881449  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.65 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.88 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.74 
 
 
300 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>