More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2028 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2028  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 767 aa  1529    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000881449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0259  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  54.01 
 
 		 743 aa  670    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  33.54 
 
 		 629 aa  247  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  27.27 
 
 		 750 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.89 
 
 		 654 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.07 
 
 		 789 aa  233  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.06 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.86 
 
 		 616 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.86 
 
 		 616 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  32.88 
 
 		 586 aa  226  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  33.56 
 
 		 586 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.97 
 
 		 607 aa  225  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  34.67 
 
 		 574 aa  224  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.43 
 
 		 628 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  32.63 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.04 
 
 		 752 aa  219  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.13 
 
 		 606 aa  219  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  37.03 
 
 		 623 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.83 
 
 		 611 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  34.55 
 
 		 626 aa  217  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.7 
 
 		 586 aa  216  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  35.15 
 
 		 631 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.77 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  32.78 
 
 		 731 aa  214  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.58 
 
 		 590 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.98 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.02 
 
 		 590 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.28 
 
 		 631 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.09 
 
 		 589 aa  209  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  32.84 
 
 		 570 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.98 
 
 		 610 aa  208  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  35.01 
 
 		 649 aa  207  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  35 
 
 		 618 aa  207  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.71 
 
 		 585 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  37.92 
 
 		 577 aa  205  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 593 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.55 
 
 		 635 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  32.5 
 
 		 575 aa  204  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.92 
 
 		 608 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  32.86 
 
 		 589 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  34.4 
 
 		 611 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.44 
 
 		 624 aa  201  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  33.97 
 
 		 654 aa  201  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.13 
 
 		 628 aa  201  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  33.18 
 
 		 577 aa  201  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  34.18 
 
 		 614 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  34.17 
 
 		 611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.95 
 
 		 810 aa  197  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  35.02 
 
 		 615 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  35.02 
 
 		 615 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0631  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.24 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0706  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.66 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.760098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.55 
 
 		 604 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  34.56 
 
 		 622 aa  196  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.56 
 
 		 606 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  34.37 
 
 		 625 aa  195  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  33.26 
 
 		 627 aa  195  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  34.79 
 
 		 615 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.93 
 
 		 592 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.2 
 
 		 613 aa  195  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.93 
 
 		 582 aa  194  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  34.02 
 
 		 617 aa  194  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  32.62 
 
 		 632 aa  194  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  34.86 
 
 		 745 aa  193  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.05 
 
 		 613 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.84 
 
 		 613 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  32.45 
 
 		 603 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  33.33 
 
 		 623 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.66 
 
 		 624 aa  192  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.18 
 
 		 624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  32.78 
 
 		 605 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.33 
 
 		 610 aa  191  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1067  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.54 
 
 		 567 aa  191  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.477245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.55 
 
 		 602 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  34.54 
 
 		 642 aa  190  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.75 
 
 		 624 aa  190  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  33.73 
 
 		 608 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  33.78 
 
 		 627 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.78 
 
 		 627 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.78 
 
 		 627 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.78 
 
 		 627 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.78 
 
 		 627 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.78 
 
 		 627 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  31.81 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.26 
 
 		 611 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.03 
 
 		 614 aa  187  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.93 
 
 		 627 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.85 
 
 		 616 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.93 
 
 		 561 aa  184  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.01 
 
 		 619 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.58 
 
 		 600 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.55 
 
 		 609 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.28 
 
 		 591 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.5 
 
 		 619 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.27 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.55 
 
 		 605 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.52 
 
 		 619 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.9 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.14 
 
 		 570 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  32.73 
 
 		 600 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>