79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1996 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.23 
 
 		 228 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.8 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.89 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.54 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.69 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.08 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.08 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.05 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.59 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.68 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.09 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.68 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.92 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.5 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.61 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.39 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  24.88 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  24.89 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  27.49 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.22 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.25 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.81 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  24.21 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.41 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.62 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.84 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  27 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.85 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.86 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.78 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.24 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.36 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  26.85 
 
 		 611 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.18 
 
 		 602 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.89 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.76 
 
 		 607 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.59 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.19 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.44 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  23.04 
 
 		 735 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.85 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.49 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.77 
 
 		 624 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.78 
 
 		 789 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.2 
 
 		 628 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.89 
 
 		 600 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.7 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  26.05 
 
 		 592 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  25.54 
 
 		 396 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.11 
 
 		 686 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  24.77 
 
 		 586 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1698  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.16 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.58 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  24.77 
 
 		 586 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.45 
 
 		 613 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.45 
 
 		 613 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.19 
 
 		 567 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.45 
 
 		 613 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.19 
 
 		 567 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  25.47 
 
 		 630 aa  42  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.61 
 
 		 610 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.19 
 
 		 567 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.19 
 
 		 567 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.19 
 
 		 567 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.95 
 
 		 241 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.89 
 
 		 565 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.76 
 
 		 611 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>