38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1384 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.18 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.95 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.05 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.28 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.12 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.89 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.94 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.94 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.54 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.54 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.85 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.64 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  31.19 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.52 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.54 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.99 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.57 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.73 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.77 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  26.06 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.39 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.07 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  23.04 
 
 		 403 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  25.56 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  22.61 
 
 		 403 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.98 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.41 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.56 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.11 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2354  cytochrome c biogenesis protein  28.43 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000264437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  27.32 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  22.86 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.81 
 
 		 218 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  28.82 
 
 		 608 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>