229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8081 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
274 aa  537  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.42 
 
 
253 aa  254  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  54.12 
 
 
243 aa  245  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  54.47 
 
 
253 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5009  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.082972  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2703  putative cytochrome C biogenesis membrane protein  52.43 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.524164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.91 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.6 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.83 
 
 
251 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  49.19 
 
 
250 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3253  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.97 
 
 
264 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0400175  normal  0.222904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0252  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.59 
 
 
255 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.25 
 
 
249 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.25 
 
 
249 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.25 
 
 
249 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4572  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  51.68 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0511  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.66 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166035  normal  0.182219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.69 
 
 
258 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.81 
 
 
291 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.7 
 
 
266 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1037  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.37 
 
 
276 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2199  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.91 
 
 
276 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.8 
 
 
249 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6714  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.56 
 
 
266 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07210  cytochrome c biogenesis protein  45.42 
 
 
274 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.3 
 
 
270 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0826  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.25 
 
 
249 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0629  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.81 
 
 
247 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162962  hitchhiker  0.0053075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.69 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.69 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.69 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.55 
 
 
257 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  42.62 
 
 
259 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24250  cytochrome c biogenesis protein  47.26 
 
 
267 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0600094  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17960  cytochrome c biogenesis protein  47.79 
 
 
256 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.26 
 
 
256 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0051  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.23 
 
 
261 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0690  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.11 
 
 
261 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.78 
 
 
256 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.98 
 
 
278 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0867  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.67 
 
 
264 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265338  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.94 
 
 
256 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6119  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50 
 
 
342 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551753  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.06 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  42.91 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2672  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.87 
 
 
270 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4517  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.66 
 
 
285 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.321232  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  40.16 
 
 
251 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.43 
 
 
244 aa  159  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.56 
 
 
244 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.8 
 
 
247 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.67 
 
 
244 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.43 
 
 
244 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.73 
 
 
247 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2733  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.66 
 
 
317 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0356838  normal  0.0597692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.26 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02950  cytochrome c biogenesis protein  44.35 
 
 
257 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.4 
 
 
250 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4097  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.48 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.326435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.56 
 
 
247 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.46 
 
 
244 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.96 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.48 
 
 
224 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  39.75 
 
 
248 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0927  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.01 
 
 
281 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.75 
 
 
248 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.34 
 
 
222 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.21 
 
 
247 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.6 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.59 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.93 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  34.84 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4260  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.49 
 
 
247 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2087  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.6 
 
 
242 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.32 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.32 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.5 
 
 
247 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.25 
 
 
259 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.14 
 
 
242 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  38.33 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.76 
 
 
245 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.96 
 
 
229 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  38.33 
 
 
248 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.39 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  37.4 
 
 
244 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.6 
 
 
242 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.42 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.92 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.77 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  36.6 
 
 
244 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2222  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.7 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.82 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.87 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.93 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.93 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.29 
 
 
249 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.84 
 
 
223 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.36 
 
 
218 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.3 
 
 
249 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.63 
 
 
240 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>