34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12892 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  100 
 
 		 287 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.81 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.82 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  53.23 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.41 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.37 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.37 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.42 
 
 		 229 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.89 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.56 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.74 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  27.31 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.03 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.07 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.82 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.86 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.75 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.34 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.18 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.92 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.44 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.89 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.86 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.41 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.18 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.84 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.35 
 
 		 218 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.48 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.48 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  20.85 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.65 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  26.03 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>