60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5227 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013747  Htur_5227  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 225 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3057  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  71.82 
 
 		 224 aa  295  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3708  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  64.09 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1633  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61.01 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.965631  normal  0.349728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.98 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  28.76 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.44 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.93 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.53 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.48 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.23 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.96 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  26.69 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.33 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0051  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.73 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.45 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.45 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.63 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.22 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0867  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.46 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265338  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.25 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.29 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.39 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.44 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.19 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.21 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  26.54 
 
 		 396 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.09 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.73 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.64 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.64 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.45 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.64 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.64 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.64 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  24.64 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.64 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.13 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.13 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  26.23 
 
 		 702 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.83 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07210  cytochrome c biogenesis protein  32.7 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0690  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.98 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02950  cytochrome c biogenesis protein  32.64 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1899  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.92 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.45 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.72 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.23 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.72 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.47 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.82 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.82 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.82 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.89 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.58 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.3 
 
 		 207 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.12 
 
 		 250 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>