41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3708 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3708  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 221 aa  414  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3057  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  64.55 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5227  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  64.09 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1633  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  64.71 
 
 		 221 aa  244  9e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.965631  normal  0.349728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.24 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.95 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.65 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.15 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.21 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.41 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.11 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.17 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.52 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.64 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2317  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.19 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000398052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  23 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.55 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.55 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.55 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.15 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  28.97 
 
 		 396 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.6 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.91 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.43 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.5 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.38 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.17 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.24 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2672  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.58 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.76 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.58 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  28.63 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.14 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  23.85 
 
 		 325 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.19 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>