255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2163 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2163  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
306 aa  585  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0104507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  67.7 
 
 
305 aa  308  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4203  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  67.32 
 
 
305 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.233468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.91 
 
 
306 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.23 
 
 
247 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.55 
 
 
303 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.78 
 
 
237 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.02 
 
 
248 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.61 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  34.63 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.66 
 
 
242 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.17 
 
 
218 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.46 
 
 
248 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.24 
 
 
240 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.24 
 
 
240 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  35.1 
 
 
271 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.12 
 
 
240 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.52 
 
 
259 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.77 
 
 
251 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.46 
 
 
227 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.96 
 
 
246 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.87 
 
 
222 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.75 
 
 
251 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.74 
 
 
238 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.74 
 
 
238 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  37.12 
 
 
244 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.45 
 
 
301 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.57 
 
 
286 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.4 
 
 
243 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  39.69 
 
 
251 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.76 
 
 
250 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  38.14 
 
 
248 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.57 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.24 
 
 
246 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  31.95 
 
 
242 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.11 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.05 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.27 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.8 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.3 
 
 
237 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.02 
 
 
247 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1522  cytochrome c biogenesis protein  34.19 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00325926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0017  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.51 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.629435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.96 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.2 
 
 
244 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.51 
 
 
244 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24700  cytochrome c biogenesis protein  36.55 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  36.17 
 
 
240 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  30.6 
 
 
403 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.02 
 
 
229 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.2 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.49 
 
 
244 aa  92.4  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.2 
 
 
253 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.2 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.33 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.19 
 
 
270 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.84 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  31.72 
 
 
403 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.94 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.44 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.91 
 
 
399 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.54 
 
 
244 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.62 
 
 
244 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  31.3 
 
 
259 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  36.99 
 
 
396 aa  89.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.36 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.83 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.4 
 
 
249 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.14 
 
 
227 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.16 
 
 
245 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.02 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.26 
 
 
222 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  38.92 
 
 
250 aa  87  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.1 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.1 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.1 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.3 
 
 
222 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  38.3 
 
 
222 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0252  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.98 
 
 
255 aa  86.3  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2672  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.1 
 
 
270 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17960  cytochrome c biogenesis protein  35.09 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.02 
 
 
256 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  35.61 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6714  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.63 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.81 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.74 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24250  cytochrome c biogenesis protein  36.08 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0600094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0130  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.63 
 
 
228 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.63 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.23 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.95 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.69 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.65 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.64 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.46 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.65 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.65 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4260  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.86 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.04 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>