More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1265 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1265  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
336 aa  676    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5540  cysteine synthase  47.28 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816879  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5905  cysteine synthase  47.28 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6411  cysteine synthase  47.28 
 
 
312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.54 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  39.27 
 
 
306 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  38.64 
 
 
307 aa  185  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.54 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  37.46 
 
 
302 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  36.88 
 
 
304 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  35.62 
 
 
310 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  35.62 
 
 
310 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  37.62 
 
 
309 aa  179  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  35 
 
 
310 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  38.19 
 
 
307 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  37.09 
 
 
304 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  35.25 
 
 
312 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  41.58 
 
 
310 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  36.21 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  40.26 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  36.88 
 
 
307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  38.51 
 
 
291 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  34.73 
 
 
307 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38.13 
 
 
298 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  36.15 
 
 
301 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  34.92 
 
 
312 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  37.33 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  36.6 
 
 
454 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22690  cysteine synthase  36.96 
 
 
321 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.794024  normal  0.909428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  38 
 
 
307 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  31.56 
 
 
300 aa  168  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  37.33 
 
 
305 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  34.55 
 
 
303 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  34.45 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  37.16 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  35.12 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.7 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  36.6 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  35.45 
 
 
303 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  37 
 
 
307 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  37.37 
 
 
320 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  37 
 
 
307 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  34.69 
 
 
349 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  35.9 
 
 
331 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  37 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  37 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  35.55 
 
 
305 aa  166  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  37 
 
 
307 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  37 
 
 
307 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  37 
 
 
307 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  37 
 
 
307 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  35.12 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  34.55 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  35.45 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  37.95 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  35.12 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  35 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.02 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  34.11 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  34.45 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  37.33 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  34.38 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  35.45 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  36.12 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  36.48 
 
 
307 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  36.48 
 
 
307 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  36.48 
 
 
307 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.83 
 
 
307 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  36.39 
 
 
461 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  36.48 
 
 
307 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  36.48 
 
 
307 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  34.11 
 
 
303 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  33.78 
 
 
303 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  33.78 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  36.33 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  33.78 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  36.31 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  36.67 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  38.05 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  33.78 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  33.78 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  33.78 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  35.4 
 
 
352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  36.48 
 
 
307 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  35.95 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  36.16 
 
 
307 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  36.33 
 
 
305 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.48 
 
 
307 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  36.67 
 
 
307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  37.25 
 
 
302 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  35.81 
 
 
325 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  37.71 
 
 
320 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  36.33 
 
 
305 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  35.71 
 
 
311 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  36.33 
 
 
305 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  36.16 
 
 
307 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  34.11 
 
 
299 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  36 
 
 
305 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  36.33 
 
 
305 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  37.54 
 
 
309 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>