More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0404 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0404  CBS domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  875    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  37.89 
 
 
427 aa  292  7e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  33.25 
 
 
429 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  32.7 
 
 
440 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  32.62 
 
 
436 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  32.61 
 
 
429 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
434 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  35 
 
 
433 aa  250  3e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  32.6 
 
 
435 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  31.75 
 
 
436 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  33.01 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  32.19 
 
 
438 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  34.12 
 
 
442 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  31.52 
 
 
436 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  30.91 
 
 
434 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  34.5 
 
 
428 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
435 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
435 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  34.07 
 
 
442 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  33.82 
 
 
442 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  30.88 
 
 
428 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0847  hypothetical protein  30.29 
 
 
440 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  hitchhiker  0.000695829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  30.38 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  31.69 
 
 
442 aa  220  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  31.12 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  30 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  30.62 
 
 
423 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  30.62 
 
 
427 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  30.92 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  29.75 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  29.75 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  30 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  30.5 
 
 
427 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  30 
 
 
431 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  29.64 
 
 
417 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  30.5 
 
 
424 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  30.25 
 
 
424 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  30.25 
 
 
424 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  30.25 
 
 
426 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  30.25 
 
 
424 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  28.71 
 
 
417 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  28.37 
 
 
424 aa  193  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  30.17 
 
 
424 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  30.07 
 
 
426 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  32.34 
 
 
423 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  29.79 
 
 
426 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  30.45 
 
 
419 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  30.64 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  29.61 
 
 
426 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  29.65 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  29.15 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  29.45 
 
 
428 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  29.18 
 
 
427 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.12 
 
 
422 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  28.61 
 
 
429 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  28.02 
 
 
429 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.49 
 
 
430 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  27.78 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  27.76 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  27.52 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1278  hypothetical protein  27.94 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00305135  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  27.58 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  27.16 
 
 
429 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  30.26 
 
 
450 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  29.2 
 
 
430 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  26.98 
 
 
421 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  28.93 
 
 
453 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  27.65 
 
 
429 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  28.16 
 
 
423 aa  169  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  26.98 
 
 
421 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  27.75 
 
 
427 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.45 
 
 
420 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  26.7 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  28.19 
 
 
424 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  26.89 
 
 
420 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  26.89 
 
 
420 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  26.89 
 
 
420 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  27.76 
 
 
427 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  26.89 
 
 
420 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  27.76 
 
 
418 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  28.93 
 
 
425 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  28.12 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  26.1 
 
 
426 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  30.03 
 
 
449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.65 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  27.47 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  27.73 
 
 
426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  27.45 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  29.07 
 
 
418 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  26.55 
 
 
429 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  25.72 
 
 
434 aa  160  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  28.87 
 
 
455 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>