More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0397 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  79.46 
 
 
453 aa  741    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  100 
 
 
449 aa  909    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  92.84 
 
 
450 aa  823    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  53.91 
 
 
440 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  52.98 
 
 
434 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  53.17 
 
 
447 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  53.93 
 
 
436 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0847  hypothetical protein  47.76 
 
 
440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  hitchhiker  0.000695829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  46.43 
 
 
438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  43.85 
 
 
436 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  43.62 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  51.38 
 
 
429 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  41.8 
 
 
434 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  40.55 
 
 
435 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  43.36 
 
 
428 aa  332  9e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  43.37 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 
435 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 
435 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  40.33 
 
 
429 aa  299  7e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  37.72 
 
 
442 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  39.45 
 
 
443 aa  293  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  37.35 
 
 
442 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  35.68 
 
 
434 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  37.12 
 
 
442 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  38.7 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  37.91 
 
 
439 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  34.76 
 
 
438 aa  283  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  36.36 
 
 
428 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  37.56 
 
 
433 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  37.82 
 
 
437 aa  276  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.6 
 
 
437 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  33.56 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  35.41 
 
 
430 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 
437 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  33.79 
 
 
440 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  33.49 
 
 
442 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  33.49 
 
 
442 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  33.26 
 
 
442 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  33.26 
 
 
442 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
442 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  33.26 
 
 
442 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  33.02 
 
 
442 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  33.26 
 
 
442 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  38.41 
 
 
443 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  34.58 
 
 
432 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  37.94 
 
 
442 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  35.28 
 
 
432 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  33.95 
 
 
432 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.8 
 
 
432 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  33.72 
 
 
432 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  36.47 
 
 
463 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1719  protein of unknown function DUF21  37.97 
 
 
449 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.444984  normal  0.388918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  34.19 
 
 
432 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2061  CBS domain protein  37.97 
 
 
449 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 
444 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  34.08 
 
 
455 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  37.05 
 
 
446 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 
427 aa  256  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  32.78 
 
 
445 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  34.95 
 
 
446 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  34.27 
 
 
441 aa  256  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
464 aa  256  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  34.41 
 
 
442 aa  255  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  33.41 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  33.57 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.74 
 
 
425 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  36.13 
 
 
434 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.33 
 
 
435 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1278  hypothetical protein  42.54 
 
 
450 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00305135  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.86 
 
 
435 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
449 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.34 
 
 
435 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.34 
 
 
435 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.34 
 
 
435 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.34 
 
 
435 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0662  hypothetical protein  33.26 
 
 
437 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  32.15 
 
 
435 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4513  hypothetical protein  35.29 
 
 
447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3851  hypothetical protein  35.29 
 
 
447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4894  hypothetical protein  35.29 
 
 
447 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149566  hitchhiker  0.000112878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
435 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
435 aa  246  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
435 aa  246  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3676  hypothetical protein  35.29 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0399185  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2245  hypothetical protein  35.29 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0633281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6830  protein of unknown function DUF21  35.21 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  37.29 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  36.24 
 
 
446 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5479  transporter, putative  36.32 
 
 
446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  32.35 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2575  CBS domain-containing protein  35.15 
 
 
446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  31.84 
 
 
451 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  34.95 
 
 
446 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0288  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
446 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5034  CBS-domain containing protein  36.32 
 
 
446 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.125258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>