107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0841 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0841  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0550321  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  52.79 
 
 		 272 aa  288  7e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  24.81 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  28.09 
 
 		 206 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  31.62 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  28.66 
 
 		 213 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  32.52 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.15 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.23 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.31 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.34 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.04 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.22 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.13 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0790  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 190 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0813  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 190 aa  46.6  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.05 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  30.3 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.71 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.61 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 214 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.48 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  35.42 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1889  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.17 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.11 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0412  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 192 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.83 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  28.46 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  28.46 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06141  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  29.17 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  28.46 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  22.7 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.02 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.02 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.02 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.02 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.02 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.21 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.85 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.76 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 218 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  28.03 
 
 		 217 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  26.47 
 
 		 224 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  31.48 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  32.32 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 197 aa  42.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>