114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1364 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1364  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  398  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.789886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2031  hypothetical protein  68.34 
 
 
208 aa  248  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  36.96 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  34.73 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  28.57 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  28.57 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  28.57 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  30.06 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  34.84 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  30.64 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  30.64 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  29.55 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  28.72 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  28.98 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  28.28 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  27.17 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  32.04 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  28.8 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  29.22 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  27.5 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  29.7 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  26.37 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  30.17 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  30.17 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0248  peptidase M50  28.85 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0246  peptidase M50  28.85 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  29.09 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  27.65 
 
 
247 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  27.22 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  27.98 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  28.1 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  30.05 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  27.18 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  26.77 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  30.15 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  27.23 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.23 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  29.26 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  27.23 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  28.48 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  27.75 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  30.1 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  25.58 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  28.96 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  32.32 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  30.35 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  28.18 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  25 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  30.35 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  27.88 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  27.88 
 
 
228 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  27.62 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  27.17 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  28.42 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  28.64 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  33.33 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  28.96 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2032  peptidase M50  27.87 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.999243  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  28.42 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  28.96 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  28.96 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  28.42 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  27.98 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  25.61 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  29.89 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  28.42 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  30.05 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  26.83 
 
 
223 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  28.08 
 
 
226 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  27.71 
 
 
223 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  28.57 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  30.05 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  30.05 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  30.05 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  30.05 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  30.05 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  28.19 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  26.67 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  26.6 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  30.41 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  29.51 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  26.78 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1369  peptidase M50  28.95 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  26.67 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  28.86 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  33.09 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  26.32 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  27.88 
 
 
260 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  29.53 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  26.63 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  29.67 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  27.85 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  27.57 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1918  M50 family peptidase  26.17 
 
 
206 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0658548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  25.45 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  27.11 
 
 
218 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  27.47 
 
 
239 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>