46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7799 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7799    100 
 
 		 1607 bp  3186    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  92.08 
 
 		 1584 bp  809    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  96.28 
 
 		 1662 bp  2706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  90.1 
 
 		 1569 bp  714    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  86.74 
 
 		 1476 bp  557  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  85 
 
 		 1641 bp  159  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  90.74 
 
 		 1680 bp  135  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  91.84 
 
 		 1596 bp  131  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  83.08 
 
 		 1662 bp  125  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  83.08 
 
 		 1662 bp  125  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  90.91 
 
 		 1653 bp  125  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  92.22 
 
 		 1656 bp  123  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  85.42 
 
 		 1662 bp  119  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  91.86 
 
 		 1698 bp  115  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  93.24 
 
 		 1683 bp  107  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  91.25 
 
 		 1665 bp  103  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  90.12 
 
 		 1602 bp  97.6  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  88.75 
 
 		 1665 bp  87.7  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  96 
 
 		 1644 bp  83.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  88.73 
 
 		 1644 bp  77.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  90.91 
 
 		 1452 bp  69.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  90.74 
 
 		 1467 bp  67.9  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  85.92 
 
 		 1443 bp  61.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  89.09 
 
 		 1455 bp  61.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  91.11 
 
 		 1068 bp  58  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  91.11 
 
 		 1119 bp  58  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  87.72 
 
 		 1176 bp  58  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0632    87.72 
 
 		 1104 bp  58  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.478667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  92.31 
 
 		 1566 bp  54  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  94.29 
 
 		 1047 bp  54  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  92.31 
 
 		 1488 bp  54  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  87.27 
 
 		 1455 bp  54  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  92.31 
 
 		 1500 bp  54  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  84 
 
 		 1044 bp  54  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  92.11 
 
 		 1344 bp  52  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  90.48 
 
 		 1539 bp  52  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  91.89 
 
 		 1008 bp  50.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  91.89 
 
 		 1023 bp  50.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  91.89 
 
 		 1029 bp  50.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  91.89 
 
 		 1014 bp  50.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  88.89 
 
 		 1206 bp  50.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  90.24 
 
 		 1509 bp  50.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  86.79 
 
 		 1497 bp  50.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  100 
 
 		 645 bp  48.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  88.64 
 
 		 1128 bp  48.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  88.64 
 
 		 1104 bp  48.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>