100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3989 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  83.65 
 
 		 104 aa  171  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  64.08 
 
 		 105 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.19 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.37 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  62.38 
 
 		 103 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.39 
 
 		 104 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  58.82 
 
 		 105 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  53 
 
 		 97 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52 
 
 		 101 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  56.57 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  60.82 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.67 
 
 		 100 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  55.67 
 
 		 100 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  51.4 
 
 		 98 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.2 
 
 		 101 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  57.29 
 
 		 94 aa  98.2  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  45.1 
 
 		 100 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  52.27 
 
 		 97 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3541  hypothetical protein  80.7 
 
 		 65 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4456  hypothetical protein  71.93 
 
 		 68 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1080  hypothetical protein  70.69 
 
 		 68 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5094  protein of unknown function DUF683  71.93 
 
 		 68 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.92 
 
 		 102 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  38.39 
 
 		 102 aa  87.4  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  45.65 
 
 		 102 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  45 
 
 		 102 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  50 
 
 		 97 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  50 
 
 		 97 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  45.65 
 
 		 102 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0976  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 105 aa  85.1  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  44.21 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  44.21 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  46.81 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  43.96 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.72 
 
 		 87 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.48 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  49.44 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.21 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  45.83 
 
 		 97 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5918  hypothetical protein  56.45 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.92 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  42.42 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  40.78 
 
 		 87 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  42.71 
 
 		 87 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.2 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1353  hypothetical protein  59.32 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0480  hypothetical protein  54.24 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1563  protein of unknown function DUF683  55.17 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0095  hypothetical protein  53.45 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.253511  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2321  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3625  protein of unknown function DUF683  50 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6220  hypothetical protein  50.85 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7732  hypothetical protein  51.72 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  37.62 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  37.23 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1513  hypothetical protein  43.75 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.266242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0237  hypothetical protein  49.06 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1231  protein of unknown function DUF683  43.75 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  31.25 
 
 		 86 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1474  hypothetical protein  53.19 
 
 		 68 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909815  hitchhiker  0.000297198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6874  hypothetical protein  36.67 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4254  hypothetical protein  43.64 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4800  protein of unknown function DUF683  41.82 
 
 		 84 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2112  protein of unknown function DUF683  39.34 
 
 		 78 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1346  hypothetical protein  36.21 
 
 		 66 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.780671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0864  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 		 665 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3936  hypothetical protein  34.48 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0231611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1792  protein of unknown function DUF683  39.62 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.77 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0030  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 665 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1820  protein of unknown function DUF683  39.62 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 665 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3583  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 665 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 665 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0090  heterodisulfide reductase subunit  32.61 
 
 		 665 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.078699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  53.12 
 
 		 51 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4481  hypothetical protein  42 
 
 		 88 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3426  heterodisulfide reductase subunit  34.21 
 
 		 665 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0368  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 		 1193 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  36 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.15 
 
 		 544 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.5 
 
 		 548 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  30.77 
 
 		 318 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0586  ferredoxin  30.23 
 
 		 289 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 385 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.38 
 
 		 427 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 990 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  29.35 
 
 		 315 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.45 
 
 		 67 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0076  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  28 
 
 		 559 aa  41.6  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.75307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 		 984 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 		 984 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 392 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0311  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.53 
 
 		 303 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.287038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.44 
 
 		 441 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>