58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4902 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  63 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  53.54 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  49.47 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  49.47 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  51.52 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  52.58 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.04 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  48.98 
 
 		 105 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  55.56 
 
 		 97 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.02 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.42 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  59.34 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.47 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  49.47 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  55.43 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  58.24 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  44.32 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.96 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  63.64 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  43.18 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  44.57 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.49 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.32 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  40.43 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  43.96 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  43.96 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  43.3 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  39.77 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  39.77 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  40.62 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.57 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  43.96 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  43.18 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  41.38 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.79 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.64 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  35.56 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  30.93 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  32.14 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  29.35 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.8 
 
 		 421 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.51 
 
 		 513 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.21 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 		 507 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.21 
 
 		 428 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  35.48 
 
 		 318 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2619  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I  28.77 
 
 		 427 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487115  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1972  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.33 
 
 		 229 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.555312 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0300  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.63 
 
 		 1189 aa  41.6  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3237  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  36.59 
 
 		 1217 aa  40  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0415733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  27.84 
 
 		 1197 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>