55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2282 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.21 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  51.02 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  55.21 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  51 
 
 		 179 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  50 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.58 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  48.42 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  48.42 
 
 		 97 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.58 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  53.19 
 
 		 95 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  45.54 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  45.54 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.48 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  49.48 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  45.92 
 
 		 105 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  43.75 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  48.94 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  46.32 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  46.32 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  51.14 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.3 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  45.26 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  45.26 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  41.58 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  42.42 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  46.32 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  49.48 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.36 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.48 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  47.42 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  45.26 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.58 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  39.18 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  40.21 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  40.21 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  41.86 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  38.95 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.19 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.95 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  38.54 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  33.33 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.78 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.39 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  51.35 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2987  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 1217 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 1192 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3120  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase-like protein  28.83 
 
 		 1178 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0811  heterodisulfide reductase subunit  31.94 
 
 		 659 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1823  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  30.39 
 
 		 1186 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.599326  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0300  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  30.28 
 
 		 1189 aa  40.4  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 392 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>