76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1830 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 
97 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 
97 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  69.07 
 
 
97 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  60 
 
 
102 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  58.95 
 
 
102 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.16 
 
 
98 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  58.62 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  55.88 
 
 
102 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  65.26 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  65.26 
 
 
97 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.6 
 
 
99 aa  110  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  63.44 
 
 
97 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  51.96 
 
 
102 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.54 
 
 
102 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.47 
 
 
101 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  53.12 
 
 
100 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.12 
 
 
100 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.48 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.86 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  45.05 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  50.52 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  46.74 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  44.57 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  49.45 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.33 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  46.39 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  46.39 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  46.81 
 
 
179 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.45 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  47.31 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.57 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.19 
 
 
104 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  45.05 
 
 
87 aa  87  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  48.89 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.15 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  51.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  43.62 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  42.11 
 
 
87 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  47.83 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  42.27 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.95 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  41.24 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  46.67 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  42.7 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  38.95 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.39 
 
 
67 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  51.35 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.27 
 
 
427 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0477  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.92 
 
 
435 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00748244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.41 
 
 
331 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.62 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
1192 aa  42  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2937  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.53 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0466  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.75 
 
 
503 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0220  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.75 
 
 
132 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.77 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1604  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.88 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.43 
 
 
437 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
431 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0995  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
366 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1601  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  28.05 
 
 
1183 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.4 
 
 
426 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.74 
 
 
432 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.36 
 
 
437 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2106  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.43 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.43 
 
 
327 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35 
 
 
578 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.36 
 
 
437 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.23 
 
 
435 aa  40  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33.8 
 
 
318 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.37 
 
 
452 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.915566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.49 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1036  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.71 
 
 
1218 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.483594  normal  0.696073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>