95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1253 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 101 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.21 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  79.21 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.21 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  51.55 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  65.56 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  51.02 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  51.02 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.84 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.84 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  68.89 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  50 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  54.64 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  59.18 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  55.43 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.06 
 
 		 99 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.48 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  50 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.96 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  48.45 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  53.61 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  54.44 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  58.51 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  49.48 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  49.48 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.04 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.04 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  51.02 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.51 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  55.32 
 
 		 94 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  43.43 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  52.13 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  50 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  41.84 
 
 		 89 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  42.86 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  42.86 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.82 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  38.78 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  36.36 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  39.8 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  37.76 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  29.59 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.62 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  31.4 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  50 
 
 		 51 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.19 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 604 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 1192 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.23 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 		 331 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0775  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 592 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291818  hitchhiker  0.00672814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.92 
 
 		 438 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.371983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1261  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 1222 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.478766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 		 652 aa  43.5  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3918  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 1212 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.35 
 
 		 421 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.05 
 
 		 286 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.87 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 367 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3966  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  30.53 
 
 		 1212 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.87 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0748  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  29.41 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0663898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 		 507 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.915566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  31.87 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0806  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 1185 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0120918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0054  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 1176 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00219154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.99 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1088  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 1177 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.806923  hitchhiker  0.00527815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.95 
 
 		 268 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0368  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 1193 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 426 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.43 
 
 		 368 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4766  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 1174 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.533642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1436  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.58 
 
 		 1175 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0265  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.05 
 
 		 427 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0854  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 590 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.473687  normal  0.869505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1328  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  26.73 
 
 		 1184 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000692132 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0603  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1178 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.149378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.52 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  30.14 
 
 		 1190 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.91 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3419  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  32.47 
 
 		 1195 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0397  heterodisulfide reductase, subunit A, selenocysteine-containing  32.89 
 
 		 461 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.89 
 
 		 437 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.6 
 
 		 394 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>