161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3489 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  77.01 
 
 
87 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  77.01 
 
 
87 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  80.49 
 
 
87 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  74.42 
 
 
87 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  75.29 
 
 
87 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.59 
 
 
87 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  61.63 
 
 
87 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  60.92 
 
 
87 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  62.07 
 
 
87 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  44.33 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  46.81 
 
 
102 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  45.74 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  45.26 
 
 
98 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.59 
 
 
89 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  44.33 
 
 
97 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  44.33 
 
 
97 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.75 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.3 
 
 
101 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.4 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  41.84 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.84 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  44.71 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  39.33 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  40.22 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  44.58 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.53 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  37.86 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  34.41 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  39.56 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  41.38 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  41.38 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.91 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  36.46 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.64 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.36 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  35.92 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  40 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  39.33 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  39.13 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  38.57 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  34.02 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.17 
 
 
427 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  44.44 
 
 
51 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.59 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
315 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.59 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 
432 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  33.82 
 
 
501 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  36.25 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.25 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  36.25 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  36.25 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  36.25 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  36.25 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  36.25 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  36.25 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  36.25 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  37.7 
 
 
500 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.93 
 
 
327 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.9 
 
 
186 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.71 
 
 
432 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
652 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.58 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 
432 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  33.33 
 
 
424 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
950 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  35 
 
 
509 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.93 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  34.48 
 
 
326 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.43 
 
 
190 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  36.99 
 
 
318 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  34.29 
 
 
502 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0864  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.57 
 
 
665 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  30.38 
 
 
183 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.86 
 
 
426 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  32.86 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0477  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.03 
 
 
435 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00748244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  36.21 
 
 
318 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.89 
 
 
238 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 
425 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  31.88 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.33 
 
 
509 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 
62 aa  42  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  34.78 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.65 
 
 
431 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  31.82 
 
 
507 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.17 
 
 
491 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  31.82 
 
 
507 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.43 
 
 
502 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.35 
 
 
90 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  28.79 
 
 
502 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>