97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0481 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 
103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64 
 
 
103 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  65.96 
 
 
95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  65.59 
 
 
98 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.4 
 
 
104 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.4 
 
 
104 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  62 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  66.67 
 
 
94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  60.82 
 
 
179 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  56.38 
 
 
105 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  60.42 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  55.43 
 
 
97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  53 
 
 
105 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  61.8 
 
 
100 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  61.8 
 
 
100 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  47.73 
 
 
100 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  52.17 
 
 
97 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  46.94 
 
 
102 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.06 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  46.94 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.11 
 
 
102 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  49.44 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  45.65 
 
 
102 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.15 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.73 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  51.72 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  51.72 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  51.14 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  47.19 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  44.83 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  44.83 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  51.11 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  41.86 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.83 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.68 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.87 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.39 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  43.96 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.96 
 
 
87 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  42.17 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.17 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  40.21 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  39.8 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  35.05 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  29.67 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.33 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  52.94 
 
 
51 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.46 
 
 
432 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36 
 
 
331 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.94 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.34 
 
 
432 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.78 
 
 
604 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1874  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.07 
 
 
362 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.05 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.37 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.72 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.72 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.38 
 
 
421 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.85 
 
 
266 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  34.25 
 
 
318 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1972  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.67 
 
 
229 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.555312 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.27 
 
 
426 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  32.14 
 
 
211 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
315 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0806  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 
1185 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0120918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  33.33 
 
 
654 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 
652 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 
648 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2988  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  31.58 
 
 
635 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371879  hitchhiker  0.00474189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1261  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
1222 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3918  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
1212 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.95 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0265  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  31.43 
 
 
427 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.95 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.18 
 
 
438 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.371983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0311  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.78 
 
 
303 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.287038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.56 
 
 
427 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.99 
 
 
429 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0573  hypothetical protein  28.21 
 
 
198 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.575358  decreased coverage  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  30.38 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.57 
 
 
369 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.99 
 
 
267 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.67 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4369  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
1193 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.278517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
500 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.21 
 
 
966 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  32.88 
 
 
213 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3966  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  29.17 
 
 
1212 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  28.28 
 
 
1190 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.478766  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  32.88 
 
 
213 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.4 
 
 
135 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.82 
 
 
437 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  32.88 
 
 
213 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>