70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0685 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
133 aa  274  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.02 
 
 
139 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.02 
 
 
139 aa  110  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0539  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
123 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1417  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.39 
 
 
102 aa  87.8  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.89 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.3 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.518316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.37 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0245  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.74 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1949  hypothetical protein  44.87 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.573256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  41.18 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.59 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0303  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.79 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0759911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.07 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.84 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0208  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40.79 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2219  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.47 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000028084  hitchhiker  0.0000143295 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.06 
 
 
432 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0370  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  40.85 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.426462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.06 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0121  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.03 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.54 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.304767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.32 
 
 
455 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.59 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 
368 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  36.14 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  34.12 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.07 
 
 
290 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  33.72 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  40.74 
 
 
497 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  30.23 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  31.33 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  31.33 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  33.73 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.05 
 
 
263 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05575  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2420  ferredoxin family protein  31.25 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.498162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05970  4Fe-4S protein  32.48 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.526653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  31.11 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.03 
 
 
461 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.12 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24680  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain G-like protein  39.73 
 
 
251 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35.48 
 
 
810 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2106  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.19 
 
 
203 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0503  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.07 
 
 
590 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.163144  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.7 
 
 
68 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4316  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 
632 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.689523  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0220  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2988  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  41.82 
 
 
635 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371879  hitchhiker  0.00474189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.91 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  35.29 
 
 
509 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.29 
 
 
509 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1972  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.49 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.555312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0164  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  44 
 
 
591 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3321  ferredoxin family protein  30 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4164  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  38.24 
 
 
632 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2260  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  31.43 
 
 
807 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1499  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.81 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000332033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
425 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  33.33 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.82 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  37.04 
 
 
597 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.52 
 
 
97 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0114  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 
161 aa  40  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.261345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 
710 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241715  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 
1016 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 
71 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.548661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>