37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0209 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 102 aa  205  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.41 
 
 		 100 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  78.43 
 
 		 100 aa  158  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0303  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  66.34 
 
 		 164 aa  140  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0759911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  64.36 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.518316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0208  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  68.42 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0245  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.36 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  71.28 
 
 		 96 aa  135  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  65.26 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1949  hypothetical protein  67.39 
 
 		 93 aa  133  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.573256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0370  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  60.44 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.426462  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.26 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.9 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.17 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.84 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0121  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.33 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2219  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.19 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000028084  hitchhiker  0.0000143295 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0539  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  34.94 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1417  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003497  iron-sulfur cluster-binding protein  35.29 
 
 		 553 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  35.71 
 
 		 502 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  35.29 
 
 		 553 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0560  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  31.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0639  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  31.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1395  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  31.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.21 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.548661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  35.71 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 		 519 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.82 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.304767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 392 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  33.73 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>